|
- 2016
北半球季节性甲型流感疫苗株HA抗原表位的分析
|
Abstract:
摘要:目的 分析近20年北半球甲型流感疫苗株血凝素(Hemagglutinin,HA)抗原的氨基酸和N-糖基化位点变异情况。方法 利用生物信息学软件分析1990-2012年季节性流感疫苗株H1N1的4个抗原决定簇Sa、Sb、Ca、Cb和H3N2的4个抗原决定簇A、B、C、D的氨基酸和N-糖基化位点变异情况。结果 (1)H1N1疫苗株Sb抗原决定簇28、40位氨基酸N-糖基化位点相对保守,而142位氨基酸发生改变。(2)Sb抗原决定簇上无N-糖基化位点。(3)H3N2疫苗株B、D抗原决定簇2、479、181、301位氨基酸N-糖基化位点相对保守,而149位氨基酸发生改变。(4)H3N2疫苗株的N-糖基化位点不在抗原位点上。结论 (1)流感疫苗株HA抗原氨基酸变异集中在HA1蛋白环状部位。(2)流感疫苗株的N-糖基化位点在相对保守的序列,并且相同亚型的流感疫苗株有相似的N-糖基化位点。(3)HA蛋白变异可以推测流感病毒基因的改变,为选择与之匹配的流行株提供参考。