2016年盐城地区手足口病A组肠道病毒VP1基因特征
Characteristics of VP1 gene of enterovirus A species of hand foot and mouth disease in Yancheng area,2016

目的 了解2016年盐城地区手足口病肠道病毒病原谱分布特征,并对鉴定为A组不同基因型肠道病毒VP1基因进行分子进化特征分析。方法 通过实时荧光RT-PCR方法对2016年盐城市疑似手足口病咽肛拭子标本进行非EV71非CVA16其他肠道病毒阳性标本的筛选,对分子分型鉴定为A组不同基因型的肠道病毒,用RT-PCR扩增各自VP1基因全长编码区并测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果 非EV71非CVA16肠道病毒基因定型结果显示共有7个基因型CVA4、CVA6、CVA10、ECHO3、ECH09、ECHO13、CVB4。遗传进化树显示,盐城地区EV71和CVA16代表株分属于C4a、B1b进化分支,CVA6型代表株分属D1、D3进化分支,CVA10型代表株属于D1基因亚群的毒株,远离各自原型株。CVA4型代表株与近年国内代表株亲缘关系较远,与原型株在同一进化谱系。结论 2016年盐城市手足病流行的病原谱呈现多样性,有多种基因型的肠道病毒同时流行,CVA6是优势病原体,EV71和CVA16仍占有一定比例。