[1] | 11 Zheng J. ; Knighton D. R. ; Eyck L. F. T. ; Karlsson R. ; Xuong N. ; Taylor S. S. ; Sowadski J. M. Biochemistry 1993, 2154. doi: 10.1021/bi00060a005
|
[2] | 12 Wei L. ; Hubbard S. R. ; Smith R. F. ; Ellis L. Curr. Opin. Struc. Biol. 1994, 4, 450. doi: 10.1016/s0959-440x(94)90115-5
|
[3] | 16 Berman H. M. Acta Crystallogr. A 2008, 64, 88. doi: 10.1107/S0108767307035623
|
[4] | 17 Das R. ; Baker D. Annu. Rev. Biochem. 2008, 77, 363. doi: 10.1146/annurev.biochem.77.062906.171838
|
[5] | 19 Zhang Y. ; Skolnick J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 2302. doi: 10.1093/nar/gki524
|
[6] | 20 Zemla A Nucleic Acids Res. 2003, 31, 3370. doi: 10.1093/nar/gkg571
|
[7] | 21 Zhang Y Curr. Opin. Struct. Biol. 2008, 18, 342. doi: 10.1016/j.sbi.2008.02.004
|
[8] | 22 Zhang Y. ; Skolnick J. Proteins 2004, 57, 702. doi: 10.1002/prot.20264
|
[9] | 23 Kryshtafovych A. ; Monastyrskyy B. ; Fidelis K. Proteins 2014, 82, 7. doi: 10.1002/prot.24399
|
[10] | 24 Laskowski R. A. ; MacArthur M. W. ; Mass D. S. ; Thornton J. M. J. Appl. Crystallogr. 1993, 26, 283. doi: 10.1107/S0021889892009944
|
[11] | 25 Eisenberg D. ; Lüthy R. ; Bowie J. Method Enzymol. 1997, 6364, 396. doi: 10.1016/S0076-6879(97)77022-8
|
[12] | 26 Park H. ; Lee J. ; Lee S. Proteins 2006, 65, 549. doi: 10.1002/prot.21183
|
[13] | 27 Trott O. ; Olson A. J. J. Comput. Chem. 2009, 2, 455. doi: 10.1002/jcc.21334
|
[14] | 28 Wang Y. ; Xiao J. ; Suzek T. O. ; Zhang J. ; Wang J. ; Bryant S. H. Nucleic Acids Res. 2009, 37, W623. doi: 10.1093/nar/gkp456
|
[15] | 33 Kryshtafovych A. ; Fidelis K. Drug Discov. Today 2009, 14, 386. doi: 10.1016/j.drudis.2008.11.010
|
[16] | 40 Nagar B. ; Hantschel O. ; Young M. A. ; Scheffzek K. ; Veach D. ; Bornmann W. ; Clarkson B. ; Superti-Furga G. ; Kuriyan J. Cell 2003, 6, 859. doi: 10.1016/S0092-8674(03)00194-6
|
[17] | 41 Knoechel T. R. ; Tucker A. D. ; Robinson C. M. ; Phillips C. ; Taylor W. ; Bungay P. J. ; Kasten S. A. ; Roche T. E. ; Brown D. G. Biochemistry 2006, 45, 402. doi: 10.1021/bi051402s
|
[18] | 6 Weinmann H. ; Metternich R. ChemBioChem 2005, 6, 455. doi: 10.1002/cbic.200500034
|
[19] | 8 Wu P. ; Nielsen T. E. ; Clausen M. H. Trends Pharmacol. Sci. 2015, 7, 422. doi: 10.1016/j.tips.2015.04.005
|
[20] | 10 Krauss G. Biochemistry of Signal Transduction and Regulation, 3rd ed., WILEY-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA:Weinheim 2004, p269.
|
[21] | 31 Biasini M. ; Bienert S. ; Waterhouse A. ; Arnold K. ; Studer G. ; Schmidt T. ; Kiefer F. ; Cassarino T. G. ; Bertoni M. ; Bordoli L. ; Schwede T. Nucleic Acids Res. 2014, 42, W252. doi: 10.1093/nar/gku340
|
[22] | 32 Ngo J. C. K. ; Chakrabarti S. ; Ding J. ; Velazquez-Dones A. ; Nolen B. ; Aubol B. E. ; Adams J. A. ; Fu X. ; Ghosh G. Mol. Cell 2005, 20, 77. doi: 10.1016/j.molcel.2005.08.025
|
[23] | 34 Rellos P. ; Pike A. C. W. ; Niesen F. H. ; Salah E. ; Lee W. H. ; von Delft F. ; Knapp S. PLoS Biol. 2010, 7, 426. doi: 10.1371/journal.pbio.1000426
|
[24] | 35 Chen P. ; Luo C. ; Deng Y. ; Ryan K. ; Register J. ; Margosiak S. ; Tempczyk-Russell A. ; Nguyen B. ; Myers P. ; Lundgren K. ; Kan C. ; Connor P. M. O. Cell 2000, 6, 681. doi: 10.1016/S0092-8674(00)80704-7
|
[25] | 36 Oliver A. W. ; Paul A. ; Boxall K. J. ; Barrie S. E. ; Aherne G. W. ; Garrett M. D. ; Mittnacht S. ; Pearl L. H. EMBO J. 2006, 25, 3179. doi: 10.1038/sj.emboj.7601209
|
[26] | 38 Jauch R. ; Cho M. ; Jakel S. ; Netter C. ; Schreiter K. ; Aicher B. ; Zweckstetter M. ; Jackle H. ; Wahl M. C. EMBO J. 2006, 25, 4020. doi: 10.1038/sj.emboj.7601285
|
[27] | 39 Elkins J. M. ; Amos A. ; Niesen F. H. ; Pike A. C. W. ; Fedorov O. ; Knapp S. Protein Sci. 2009, 4, 782. doi: 10.1002/pro.82
|
[28] | 4 Cohen P. Nat. Rev. Drug Discov. 2002, 4, 309. doi: 10.1038/nrd773
|
[29] | 5 Manning G. ; Whyte D. B. ; Martinez R. ; Hunter T. ; Sudarsanam S. Science 2002, 298, 1912. doi: 10.1126/science.1075762
|
[30] | 13 Dancey J. ; Sausville E. A. Nat. Rev. Drug Discov. 2003, 2, 296. doi: 10.1038/nrd1066
|
[31] | 14 Goldstein D. M. ; Gray N. S. ; Zarrinkar P. P. Nat. Rev. Drug Discov. 2008, 7, 391. doi: 10.1038/nrd2541
|
[32] | 15 Fiser A. Methods Mol. Biol. 2010, 673, 73. doi: 10.1007/978-1-60761-842-3_6
|
[33] | 18 Xu M. ; Yu L. ; Wan B. ; Yu L. ; Huang Q. PloS One 2011, 7, e22644. doi: 10.1371/journal.pone.0022644
|
[34] | 29 Karaman M. W. ; Herrgard S. ; Treiber D. K. ; Gallant P. ; Atteridge C. E. ; Campbell B. T. ; Chan K. W. ; Ciceri P. ; Davis M. I. ; Edeen P. T. ; Faraoni R. ; Floyd M. ; Hunt J. P. ; Lockhart D. J. ; Milanov Z. V. ; Morrison M. J. ; Pallares G. ; Patel H. K. ; Pritchard S. ; Wodicka L. M. ; Zarrinkar P. P. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 127. doi: 10.1038/nbt1358
|
[35] | 30 Huey R. ; Morris G. M. ; Olson A. J. ; Goodsell D. S. J. Comput. Chem. 2007, 6, 1145. doi: 10.1002/jcc.20634
|
[36] | 37 Meng W. J. Biol. Chem. 2002, 277, 37401. doi: 10.1074/jbc.C200418200
|
[37] | 42 Biondi R. M. ; Komander D. ; Thomas C. C. ; Lizcano J. M. ; Maria D. ; Alessi D. R. ; Aalten D. M. F. EMBO J. 2002, 21, 4219. doi: 10.1093/emboj/cdf437
|
[38] | 43 Knight Z. A. ; Shokat K. M. Chem. Biol. 2005, 12, 621. doi: 10.1016/j.chembiol.2005.04.011
|
[39] | 1 Hunter T. Cell 2000, 100, 113. doi: 10.1016/S0092-8674(00)81688-8
|
[40] | 2 Noble M. E. M. Science 2004, 303, 1800. doi: 10.1126/science.1095920
|
[41] | 3 Bild A. H. ; Yao G. ; Chang J. T. ; Wang Q. ; Potti A. ; Chasse D. ; Joshi M. ; Harpole D. ; Lancaster J. M. ; Berchuck A. ; Olson J. A. ; Marks J. R. ; Dressman H. K. ; West M. ; Nevins J. R. Nature 2005, 439, 353. doi: 10.1038/nature04296
|
[42] | 7 Vieth M. ; Sutherland J. J. ; Robertson D. H. ; Campbell R. M. Drug Discov. Today 2005, 10, 839. doi: 10.1016/s1359-6446(05)03477-x
|
[43] | 9 Scheeff E. ; Bourne P. PLoS Comput. Biol. 2005, 1, e49. doi: 10.1371/journal.pcbi.0010049.eor
|