人IDE基因启动子生物信息学分析
Bioinformafics analysis of human IDE gene promoter region

对人IDE基因启动子进行生物信息学分析以获得人IDE基因启动子、CpG岛及转录因子结合位点特征.从UCSC基因组数据库成功获得人IDE基因5’调控区2 000 bp序列.Promoter 2.0、FPROM、NNPP预测人IDE基因分别有3个、2个、6个启动子.Relative profile score threshold选择80%、85%、90%、95%、100%时，JASPAR预测该序列存在5170、1771、454、87和5个可能的转录因子结合位点.Relative profile score threshold选择80%，搜索到6个潜在的TCF7L2转录因子结合位点.采用进化足迹法，LAGAN预测方法获得位于人和小鼠同源IDE基因启动子保守区域相同位置的转录因子结合位点为14个，包含转录因子SPI-1、cap、c-FOS、FREAC-3、c-ETS、Cdxa、HSF2等.发现一个CpG岛，位于1 303～1 705 bp 之间，大小为403 bp.人IDE基因启动子、CpG岛及转录因子结合位点的生物学信息学分析，为下一步基因表达调控实验奠定了基础.