武汉地区丙型肝炎病毒包膜蛋白E1的生物信息学研究
Bioinformatic study of hepatitis C virus envelope protein E1 in Wuhan

使用生物信息学的方法，分析武汉地区不同基因型、亚型的丙肝病毒的包膜E1蛋白，预测其二级结构、核苷酸变异性、糖基化位点、亲水性、跨膜区、信号肽、蛋白修饰位点、B细胞抗原.结果显示各HCV的包膜E1蛋白二级结构差距不大；序列始末段有数个氨基酸残基的差距，序列上存在高变异位点，基因型2a的型内一致性最高；序列大量糖基化，有多个糖基化基化位点；序列分布着亲水性区域，基因型1b的分值很高；基因型1b、6a、3b、3a多数亚型有1个跨膜区，基因型2a多数亚型有两个跨膜区；基因型1b、6a、3b、3a无信号肽，基因型2a都有信号肽；蛋白序列上存在多个不同修饰位点和B细胞抗原，各基因型、亚型之间有明显差距，具有较大异质性.该研究为揭示病毒感染机制和研制地区性疫苗提供一定的科学依据.