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ISSN: 2333-9721
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-  2017 

多种lncRNA可影响黑色素瘤的发生和发展
Multiple lncRNAs affect the incidence and#br# development of melanoma

DOI: 10.11817/j.issn.1672-7347.2017.02.003

Keywords: 黑色素瘤,长链非编码RNA,基因表达,数据提取,预测模型,
melanoma
,lncRNA,gene expression,data extraction,prediction model

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Abstract:

目的:通过生物大数据挖掘,探讨长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)与黑色素瘤发生发展的 关系。方法:从基因表达综合数据库中的黑色素瘤mRNA表达谱数据集GSE15605中提取出一些lncRNA的表达信息, 并分析这些lncRNA与黑色素瘤的关联关系。结果:LINC01213,PGM5-AS1,LINC01133和LOC284578共4个lncRNA 与黑色素瘤的发生和转移显著相关,其中LINC01213,LINC01133和LOC284578的表达可被BRAF基因突变影响,而 PGM5-AS1的表达能被NRA S基因突变影响。利用这4个lncRNA的表达值构建的预测模型可较好地区分正常样本、初发 黑色素瘤样本和转移性黑色素瘤样本。结论:LncRNA可能在黑色素瘤的发生和转移中起重要作用

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