|
- 2016
DNA条形码及其在生物多样性研究中的应用
|
Abstract:
中文摘要:DNA条形码是利用生物体内标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段对物种进行快速准确鉴定的技术。自2003年DNA条形码相关概念提出以来广受关注,国内外相继开展了DNA条形码及信息系统建设研究,为DNA条形码技术的发展提供了坚实的研究基础和生物信息学分析平台。DNA条形码技术弥补了传统分类学的不足,为生物多样性研究提供了新的思路和方法。本文介绍了DNA条形码的产生与发展过程,国内外DNA条形码技术与信息系统建设研究进展,重点阐述了DNA条形码技术在物种鉴定、濒危物种保护、隐存种发现、生物多样性评估等研究领域中的应用。最后结合DNA条形码技术目前存在的问题,对其在相关研究领域的应用前景进行了展望。
英文摘要:DNA barcoding is a technology for accurate and rapid identification of species by analyzing standard short DNA sequences with enough variation in the organism. The concept of DNA barcoding has attracted widespread attention since 2003. More and more projects focused on DNA barcoding and information system construction have been carried worldwide, and provide a solid foundation and bioinformatics analysis platform for the development of DNA barcoding. DNA barcoding makes up for the shortcomings of traditional taxonomy and provides new ideas and methods for biodiversity research. Here we provided a brief introduction for the research progress of DNA barcoding, and reviewed its applications and advances in species identification, endangered species protection, cryptic species, and biodiversity assessment. We also discussed the problems of DNA barcoding and gave a prospect for its application in biodiversity. 2016,35(6): 942-949 收稿日期:2016-05-12 DOI:10.11984/j.issn.1000-7083.20160123 分类号:Q523 基金项目:江苏省自然科学基金项目(BK20131087);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目(2013);江苏省大学生实践创新训练计划项目(201514436007Z) 作者简介:陈炼(1982-),女,博士,副研究员,主要从事分子生态学研究,E-mail:chenlian_2004@163.com *通讯作者:徐海根,E-mail:xhg@nies.org 参考文献: 陈士林, 姚辉, 韩建萍, 等. 2013. 中药材DNA条形码分子鉴定指导原则[J]. 中国中药杂志, 38(2):141-148. 陈岩, 张立, 刘力, 等. 2014. 我国检疫性有害生物DNA条形码信息系统建设[J]. 植物检疫, 28(1):1-5. 戴传银, 张瑞莹, 尹祚华, 等. 2010. 部分山雀科鸟类的DNA条形码与物种识别[J]. 动物分类学报, 35(4):835-841. 郭锐, 张守纯, 宋艳珠. 2012. 9种鹤类DNA条形码的研究[J]. 中国农学通报, 28(14):50-55. 李超, 王正亮, 杨倩倩, 等. 2014. DNA条形码技术的应用研究[J]. 中国计量学院学报, 25(3):231-237. 裴男才. 2012. 利用DNA条形码技术识别植物物种[J]. 应用生态学报, 23(5):1240-1246. 杨慧洁, 杨世海, 张淑丽, 等. 2014. 药用植物DNA条形码研究进展[J]. 中草药, 45(18):2581-2587. 张宇, 郭良栋. 2012. 真菌DNA条形码研究进展[J]. 菌物学报, 31(6):809-820. 赵广宇, 李虎, 杨海林, 等. 2014. DNA 条形码技术在昆虫学中的应用[J]. 植物保护学报, 41(2):129-141. CBOL Plant Working Group. 2009. A DNA barcode for land plants[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 106(31):12794-12797. Che J, Chen HM, Yang JX, et al. 2012. Universal COⅠ primers for DNA barcoding amphibians[J]. Molecular Ecology Resourses, 12(2):247-258. Chen WT, Ma XH, Shen YJ, et al. 2015. The fish diversity in the upper reaches of the Salween River, Nujiang River, revealed by DNA barcoding[J]. Scientific Reports, 5:17437. China Plant BOL Group, Li