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- 2018
白腹鹭 COⅠ和 Cyt b基因序列分析及鹭属系统发育研究
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Abstract:
中文摘要:白腹鹭 Ardea insignis数量稀少,被世界自然保护联盟列为极危(CR)物种,关于该物种的生态信息和分子生物学研究极少。本研究通过扩增得到了白腹鹭的2个线粒体基因序列( COⅠ和 Cyt b), Cyt b基因序列长度为1 163 bp,其中的A+T含量(51.7%)高于C+G(48.3%),第三位点上碱基偏倚最突出; COⅠ基因序列长度为722 bp,A+T含量(52.5%)高于C+G(47.5%),碱基偏倚同样在第三位点最明显。结合来自GenBank鹭属 Ardea其他6个物种的 COⅠ和 Cyt b基因序列,构建鹭属的系统发育树,结果表明,鹭属7种鸟类构成单系,后验概率支持度为96%,大白鹭 A. alba和白腹鹭在鹭属中是较早分化出的类群,位于鹭属分支的基部;白腹鹭与草鹭 A. purpurea的遗传距离最近。
英文摘要: Ardea insignis is a rare species and listed as a critically endangered species in the IUCN red list of threatened species. It belongs to genus Ardea of family Ardeidae. There are very few studies carried on this species. We obtained COⅠ and Cyt b gene sequences of A. insignis using PCR technology. The length of the Cyt b gene was 1 163 bp, and the A+T content (51.7%) was higher than that of C+G (48.3%). The length of the COⅠ gene was 722 bp, and the A+T content (52.5%) was also higher than that of C+G (47.5%). The third site of both genes showed the most remarkable base bias. Combined with the sequences of the other 6 Ardea species from GenBank, the phylogenetic tree of genus Ardea was constructed. The result showed that 7 species of genus Ardea formed a monophyletic clade with the posterior support at 96%. A. alba and A. insignis were found at the basal position of this clade, indicating their early diverge. Based on the genetic analysis, A. purpurea was considered to be the most closely related species to A. insignis. 2018,37(3): 268-273 收稿日期:2017-11-10 DOI:10.11984/j.issn.1000-7083.20170353 分类号:Q959.7 基金项目:环保部生物多样性示范观测项目(2016-2017);云南省极小种群物种拯救保护项目(2016) 作者简介:陈熙(1993-),女,硕士研究生,研究方向:野生动植物保护与利用,E-mail:18387158232@163.com *通讯作者:罗旭,副教授,研究方向:鸟类进化、生态与保护,E-mail:xu_luo@aliyun.com 参考文献: 常青, 张保卫, 金宏. 2003. 从12s RNA基因序列推测鹭类13种鸟类的系统发生关系[J]. 动物学报, 49(2):205-210. 高英凯, 苗正旺, 苏小茜, 等. 2009. 74种鸟类线粒体基因组碱基组成及特征分析[J]. 云南农业大学学报, 24(1):51-58. 韩联宪, 何臣相, 王斌, 等. 2015. 云南发现白腹鹭[J]. 四川动物, 34(2):281. 黄原. 2012. 分子系统发生学[M]. 北京:科学出版社. 蒋志刚, 江建平, 王跃招, 等. 2016. 中国脊椎动物红色名录[J]. 生物多样性, 24(5):500-551. 张保卫, 常青, 魏辅文. 2002. 鹭科鸟类分类及系统学研究进展[J]. 动物学杂志, 37(3):84-88. 张国萍, 王蔚, 朱世杰, 等. 2005. 鹳形目12种鸟类核c-mos基因和线粒体12s rRNA基因序列分析及其系统发生研究[J]. 四川动物, 24(4):500-506. 郑光美. 2017. 中国鸟类分类与分布名录(第三版)[M]. 北京:科学出版社. 郑作新. 1964. 中国鸟类系统检索[M]. 北京:科学出版社:9-12. 郑作新. 1994. 中国鸟类种和亚种分类名录大全[M]. 北京:科学出版社:9-11. 钟东, 赵贵军, 张振书, 等. 2002. 基因组内碱基分布整体均衡与局部不均衡的研究进展[J]. 遗传, 24(3):351-355. Arnaiz-Villena A, Guillén J, Ruiz-del-Valle V, et al. 2001. Phylogeography of crossbills, bullfinches, grosbeaks, and rosefinches[J]. Cellular and Molecular Life Sciences, 58(8):1159-1166. Ben FK, Edward CD, Martin WW. 1975. A field guide to the birds of south-east