p53突变体Y220C小分子稳定剂的虚拟筛选

摘要 为了获得p53突变体的稳定剂, 依次利用利宾斯基五原则, 通过2次分子对接和全原子分子动力学(MD)模拟从DrugBank 4.0 数据库中筛选获得了潜在的稳定剂他克林. 利用MD模拟进一步验证他克林和目标蛋白质之间的亲和作用. 结果表明, 他克林能够紧密结合到Y220C突变所形成的疏水空腔之中; 他克林和目标蛋白质之间的主要作用力为疏水和静电相互作用, 其中疏水相互作用占主导地位. 此外, 他克林分别与目标蛋白质的残基Leu145, Val147和Asp228形成3个氢键. 基于MD模拟轨迹分析了他克林与p53C-Y220C的结合过程. 由硫黄素T荧光光谱进一步证明他克林能够提高p53C-Y220C突变体的稳定性