鲚属单核苷酸多态性位点(SNPs)标记开发及在物种界定中的应用初探

单核苷酸多态性（SNP）分子标记结合二代测序技术是研究群体遗传学强有力的工具，同时也是界定物种的最佳方法之一。与以往获取SNPs数据的常用方法相比，靶基因富集的方法可以用来富集不同物种的同源片段，甚至可以用于部分降解的DNA。本研究应用一套通用的脊椎动物单拷贝核基因标记，通过基因富集和Illumina测序获取鲱形目鲚属数千个SNPs位点。样本取自靠近长江入海口的沿海地区、长江干流和洞庭湖。用STRUCTURE和Bayes factor delimitation（*with genomic data，BFD*：一种新的物种界定工具）分析SNPs数据，发现洞庭湖的短颌鲚显著不同于其他采样点的样本，而从沿海地区采集的刀鲚与长江干流的个体之间的差异不明显（Bayes factor=11.3）。研究表明，基因富集可以用来获得非模式生物的SNPs数据，结合新的分析工具如BFD*可用于物种界定