上海港到港船舶压载水沉积物细菌群落多样性

为了解船舶压载水沉积物中微生物多样性，利用Illumina MiSeq 2500高通量测序平台对上海港到港船舶压载水沉积物中细菌基因样本进行测序，并进行生物信息分析。从11份压载水沉积物样品中共检测到420 069条有效序列，微生物群落分析结果显示共有38门、98纲、226目、393科、704属细菌，优势类群为变形菌门（Proteobacteria 72.98%）、放线菌门（Actinobacteria 9.11%）、拟杆菌门（Bacteroidetes 8.71%）、绿弯菌门（Chloroflexi 4.06%）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes 1.47%）、酸杆菌门（Acidobacteria 1.18%）和其他（2.50%）。本次研究在压载水沉积物中检测到了分枝杆菌属（Mycobacterium）、游动球菌属（Planococcus）、假单胞菌属（Paenibacillus）、类芽孢杆菌属（Streptomyces）和链霉菌属（Inquilinus）的致病菌或条件致病菌。结果显示压载水沉积物中微生物多样性丰富，要充分重视我国到港船舶压载水沉积物中微生物以及致病菌的研究，为阐明外来致病菌通过压载水途径入侵的机制和防控奠定基础