山地虎耳草转录组SSR信息分析
Analysis of SSR Information in Transcriptome Sequences of Saxifraga sinomontana

利用MISA（MicroSatellite）软件对山地虎耳草转录组拼接序列进行微卫星位点信息分析，为后期SSR标记的开发和物种遗传多样性检测提供候选序列。结果发现，在拼接得到的63 763条Unigene序列中含有4 622个SSR，发生频率为7.25%，有110种重复基元，平均每10.00 kB出现一个SSR位点。山地虎耳草转录组序列的SSR主要集中在三核苷酸重复（55.50%），其次为二核苷酸重复（30.23%）。二核苷酸重复和三核苷酸重复中的优势重复基元分别为AG/TC和AAG/TTC。二核苷酸重复基元的重复次数类型最多，跨度最大，具有更高的多态性，三核苷酸次之，而四、五、六核苷酸重复类型很少。山地虎耳草转录组SSR以5~9次重复为主，且SSR数量随着重复次数的增加逐渐减少，基序长度主要集中于12~30 bp，多态性均在中等以上。