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ISSN: 2333-9721
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植物研究  2017 

杨树MYB转录因子家族基因应答盐胁迫表达特性分析
Expression Analysis of Poplar MYB Transcription Factor Gene Family in Response to Salt Stress

DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2017.03.013

Keywords: 杨树,MYB转录因子,生物信息学,RT-qPCR,
Poplar
,MYB transcription factors,bioinformatics,RT-qPCR

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Abstract:

MYB转录因子家族是植物中数量最多的转录因子家族之一,在植物次生代谢调节、信号转导和抗逆等生物过程起重要作用。根据MYB转录因子结构域组成差异可分4个亚家族:即1R-MYB(MYB-relaed)、R2R3-MYB、3R-MYB和4R-MYB。其中,R2R3-MYB亚家族数量最多,可进一步分为22个亚组;利用生物信息学分析杨树MYB转录因子蛋白序列的保守结构域、系统发生、基因组定位、氨基酸组成和理化性质等;参照拟南芥MYB转录因子功能,预测杨树MYB转录因子功能;基于84K杨转录组测序和RT-qPCR分析,从301个杨树MYB转录因子基因中筛选出69个应答盐胁迫基因(P≤0.05)。其中,上调表达基因32个,下调表达基因37个。该研究可为进一步研究杨树MYB家族基因功能提供参考依据。

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