青藏高原特有种-藏扇穗茅叶绿体基因组测序及序列分析
Sequencing and Alignment Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Littledalea tibetica,an Endemic Species from the Qinghai-Tibet Plateau

藏扇穗茅（Littledalea tibetica）是禾本科（Poaceae）雀麦族（Bromeae）中一个具有重要生态价值的多年生高山特有种，主要分布于青藏高原及其毗邻地区。本文采用基于第二代高通量测序平台的Illumina MiSeq技术，对青藏高原特有种—藏扇穗茅进行了叶绿体基因组测序，首次建立了雀麦族物种的标准测序流程；同时，以其近缘物种—黑麦草（Lolium perenne）的叶绿体基因组序列作为参考，组装获得它的叶绿体基因组序列。结果表明，藏扇穗茅叶绿体基因组序列全长136 852 bp，GC含量为38.5%，呈典型的四段式结构，其中大（LSC）、小（SSC）单拷贝区大小分别为80 970和12 876 bp，反向互补重复区（IR）大小为21 503 bp，共注释得到141个基因，包含95个蛋白编码基因、38个tRNA基因和8个rRNA基因，主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区。同时，基于藏扇穗茅和其它30种禾本科植物叶绿体基因全序列构建的系统发育树显示，藏扇穗茅与早熟禾亚科中小麦族植物亲缘关系较近。