小黑杨HD-Zip转录因子家族生物信息学及应答盐胁迫分析
Bioinformatics and Response to Salt Stress Analysis of the HD-Zip Transcription Factor Family in Populus simonii×P.nigra

HD-Zip转录因子基因是植物中特有的一类蛋白家族，在植物生长发育和逆境应答胁迫过程中发挥重要作用。HD-Zip转录因子基因是由高度保守的同源异型结构域（HD）和亮氨酸拉链域（LZ）结构域构成的特殊结构模型。杨树HD-Zip转录因子家族共有63个基因，可被分为HD-ZipⅠ、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ四个亚家族。本文利用RNA-Seq分析了盐胁迫条件下HD-Zip基因家族在小黑杨根、茎、叶等不同组织的基因表达差异，从转录组水平揭示其应答胁迫环境的分子机制，结果表明，盐胁迫下在叶中有25个HD-Zip基因下调表达，21个基因上调表达；茎中有42个基因下调表达，11个基因上调表达；根中有26个基因下调表达，24个基因上调表达。另外，本文根据拟南芥HD-Zip转录因子家族基因的已知功能，预测了杨树HD-Zip转录因子同源基因的功能，并利用生物信息学方法分析了杨树HD-Zip转录因子蛋白序列的保守结构域、氨基酸组成和理化性质等，为进一步研究杨树HD-Zip转录因子基因功能提供参考。