青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD 序列的分子进化特点
Characteristic of Molecular Evolution for Lilium pumilum Redouté on Southeast of the Qinghai-Tibetan Plateau using nrDNA ITS and cpDNA petB/petD Sequence Analysis

采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA，选取核基因ITS和叶绿体petB/petD区域进行PCR扩增、纯化和测序。对所有序列对位排列，其中ITS序列总长696bp，变异位点有4处，共产生7种单倍型，变异位点百分率为0.72%，（G+C）含量60.4%；petB/petD序列总长616bp，仅1处变异位点和2种单倍型，变异位点百分率为0.16%，（G+C）含量34.6%。表明山丹中，petB/petD区域较ITS序列保守，变异速率较慢。对ITS序列单倍型进行失配分布和中性检验分析发现，山丹现有分布范围可能经历了近期居群小范围扩张，AMOVA分析发现山丹居群的遗传变异主要存在于居群内，NST >GST（P>0.01），表明山丹的遗传变异有着不显著的谱系地理结构。因此，山丹ITS序列适合该种的谱系地理学研究。