极度濒危植物巧家五针松基因组微卫星特征分析
Characterization of Microsatellites in Genome of Pinus squamata, a Critically Endangered Species in the World

巧家五针松是世界极度濒危植物，对其SSR引物的开发有助于其遗传学研究以及物种的保护。本研究通过Illumina高通量测序技术获得巧家五针松全基因组序列，并以MISA软件查找得到2 651个微卫星序列，其中单核苷酸重复最多，可能预示了其悠久的进化历史。不同重复类型中，A/T含量显著高于G/C；在不同长度重复单元中，二核苷酸重复微卫星长度变异程度最高；各重复类型微卫星长度与微卫星出现的频率成反比。获得的微卫星序列能够满足巧家五针松的种群遗传学研究，而且反映了该物种的偏好性及对应的潜在功能，并且对该物种的保护提供了资料。