基于高通量测序的云南松转录组分析
Transcriptome Analysis for Pinus yunnanensis Based on High Throughput Sequencing

采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hiseq 2 000对云南松转录组测序，得到的数据进行de novo组装，获得80 000条Unigenes，N50为1 881 nt、平均890 nt。与公共数据库进行比对，注释到NR、NT、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为43 434、46 415、29 418条。将Unigenes与COG数据库比对，有14 792条Unigenes成功注释，根据功能大致分成25类；与GO数据库比对，有26 743条Unigenes获得注释，按功能分为细胞组分、分子功能和生物过程3大类55亚类，其中参与的生物过程较多；以KEGG数据库参考，有25 873条Unigenes参与128条代谢途径分支，以代谢相关的通路较为集中，并找到与木质素合成关键酶的Unigenes。这些研究极大地扩充了云南松的基因资源，将有助于云南松基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良的研究等。