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ISSN: 2333-9721
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-  2018 

基于生物信息学的小麦ALAD基因的鉴定和分析

DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2018.11.03

Keywords: 普通小麦,ALAD基因,表达分析,突变体分析

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Abstract:

5-氨基乙酰丙酸脱水酶(δ-aminoaevulinic acid dehydratase,ALAD)是生物体所有四吡咯化合物生物合成所必需的酶。为了给ALAD基因功能研究奠定基础,本研究根据模式植物拟南芥和水稻的ALAD基因序列,利用生物信息学手段对普通小麦ALAD基因进行鉴定和分析。结果表明,普通小麦有6个ALAD基因,其中TaALAD-A1、TaALAD-B1和TaALAD-D1基因位于第七同源群染色体长臂,而TaALAD-A2、TaALAD-B2和TaALAD-D2基因位于第六同源群染色体短臂。6个ALAD基因均含有保守的ALAD结构域,但系统发育分析中可分为2组。转录组数据表达分析结果显示,TaALAD-1基因在各个组织中的表达量均高于TaALAD-2,但两者在叶片中的表达量均最高。干旱胁迫对小麦TaALAD-1和TaALAD-2的表达几乎影响;TaALAD-1的表达量在热胁迫1 h下调,而在热胁迫6 h时上调;热胁迫1 h和6 h对TaALAD-2的表达几乎影响。通过小麦TILLING数据库分析,6个TaALAD基因都找到了数量不同的突变位点,其中一些突变位点为起始位点突变、义突变、转录终止位点突变和剪切位点突变,可能影响该基因的功能。

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