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ISSN: 2333-9721
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-  2016 

滨麦蔗糖:果聚糖6-果糖基转移酶(6-SFT)基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2016.05.02

Keywords: 滨麦,6-SFT基因,克隆,序列分析

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Abstract:

为了挖掘和利用滨麦(Leymus mollis,2n=4x=28,JJNN)的优良基因,以拓宽小麦非生物胁迫抗性基因资源,以滨麦为材料,利用RT-PCR结合RACE技术从滨麦叶片中克隆到 6-SFT基因cDNA的全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,其cDNA全长为2 086 bp,开放阅读框为1 866 bp(命名为 Lm-6-SFT),编码621个氨基酸;其推导的蛋白分子量为69.1 kDa,理论等电点(pI)为5.18,属于酸性蛋白。保守结构域分析表明,该基因推导的氨基酸序列含有SDPDG、RDP和EC结构域。多序列比对及进化树分析表明,滨麦6-SFT与冰草6-SFT在氨基酸水平具有高度的序列相似性。

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