沙棘H3K9乙酰化修饰全基因组分析

为了绘制沙棘H3K9乙酰化修饰图谱，确定H3K9乙酰化修饰所调控的基因，该实验通过Western blot验证抗体与组蛋白的结合能力和ChIP seq验证抗体富集效率，获得全基因组范围内沙棘H3K9乙酰化修饰图谱和调控基因。实验结果表明，H3K9ac抗体与复合物具有较强的结合能力。对富集到的DNA片段进行高通量测序，分别获得2.2×107和3.6×107条原始序列；唯一比对序列广泛分布于沙棘基因组中，并且在结构基因中的两端具有明显的富集。对富集区进行峰的预测结果显示，共预测出1 011个峰；对峰所处部位基因进行功能预测结果发现，H3K9ac对于沙棘细胞代谢和信号转导基因的表达具有重要调控作用。沙棘片段化DNA的富集以及高通量测序结果证明，抗体能够用于研究沙棘的组蛋白修饰类型，并且绘制了沙棘第一张H3K9乙酰化修饰遗传图谱草图，鉴定出沙棘H3K9乙酰化修饰所调控的基因，为今后研究组蛋白修饰对沙棘基因表达的调控方式奠定了基础。