龙眼miR171家族进化特性及其表达分析

为了解龙眼miR171家族的进化特性及其功能，该研究以龙眼mRNA和miRNA数据库中获得的miR171家族7个前体序列(pre miRNA)和9条成熟体序列为基础进行生物信息学预测和表达分析。mfold预测显示，pre miR171家族成员均能形成典型二级结构，其最小折叠自由能（dG）介于 -39.37~ -55.13 kal/mol，且家族成员中除pre miR171 scaffold112和pre miR171f scaffold38外，其他成员包含的成熟序列与vvi miR171a、ptc miR171f以及ctr miR171等成熟体完全匹配。NJ进化树分析发现，龙眼pre miR171家族与柑橘、毛果杨具有较高相似性。psRNAtarget靶标预测显示，龙眼miR171家族的主要靶标为Scarecrow like6，与其他植物的miR171靶标相同。实时荧光定量PCR分析表明，pre miR171家族成员均在龙眼雄花中表达提高，而在果实中表达量降低。研究认为，龙眼miR171家族在进化过程中具有高度保守性，在龙眼生长发育过程中主要参与雄花形成。