棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆

该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针，从陆地棉TM 1全基因组测序数据库中筛选其同源序列，序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列。对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析，发现它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有较高相似度，其中15条基因序列包含5个保守结构，1条包含4个保守结构。在此基础上，采用RT PCR方法从抗枯萎病的陆地棉品种‘中棉所12’中克隆得到一个新的EIN3/EIL家族基因，命名为GhEIL3（GenBank登录号为KY072936）。序列分析表明：GhEIL3基因开放阅读框长1 092 bp，编码363个氨基酸，含有一个EIN3结构域。实时荧光定量PCR(qRT PCR)结果显示，GhEIL3基因在枯萎病菌诱导后呈上调表达，诱导后1 h其相对表达量达到最大值，推测GhEIL3基因可能参与棉花对枯萎病菌的防御反应。