白芨SSR引物筛选及群体遗传多样性研究

白芨(Bletilla striata Rchb.)为中国珍稀濒危植物，重要的药用植物。该研究基于Illumina测序技术构建白芨基因组文库和微卫星文库，设计白芨微卫星引物，用白芨4个野生种群80个个体对引物进行多态性检测，应用4个白芨近缘种中进行引物的通用性检测，并在此基础上分析了白芨的遗传多样性和遗传分化，以探讨白芨的遗传结构和进化潜能。结果表明：（1）白芨基因组中微卫星片断丰富，共检测出17 841条微卫星片断。基于白芨微卫星库对100个位点设计了引物对，经PCR扩增和检测筛选出能够稳定扩增的多态性位点20个，每个位点的复等位基因数（Na）在2~6之间，平均为3.85；20对引物的大部分能够在4个白芨近缘种中成功扩增。（2）白芨在物种水平均有较高的遗传多样性（Na=3.85，I=1.07，H=0.614 7），白芨种群遗传分化强烈（Gst=0.43），居群间的基因流较弱（Nm= 0.867 6），居群聚类分析结果均表明地理距离较近的居群具有较近的遗传关系。