向日葵E3泛素连接酶基因克隆及表达分析

该研究从向日葵中克隆了E3泛素连接酶基因HERC2，并进行了生物信息学分析和不同胁迫条件的表达分析。序列分析表明，HERC2（登录号为KT832066）序列的CDS为1 608 bp，编码535个氨基酸，预测其分子量131 kD，等电点为5.03。HERC2编码的蛋白质为疏水性蛋白质，且为细胞质蛋白；亚细胞定位预测分析表明，向日葵HERC2可能定位在高尔基体中；该蛋白质有5个RCC1保守结构域。向日葵HERC2与已报道的其他植物同源蛋白有相似的保守区域，与醉蝶花亲缘关系最近，而与大豆和野生大豆的亲缘关系最远。与HERC2 cDNA对应的gDNA（登录号为KT832067）的ORF长度为3 409 bp，与cDNA编码序列比对结果表明，该gDNA由5个外显子和4个内含子组成。实时荧光定量PCR分析表明，向日葵HERC2基因表达受非生物胁迫调节，在不同器官及不同非生物胁迫下存在特异性表达差异。研究认为，HERC2基因应答逆境胁迫具有其特定的表达模式，研究结果为加强对HERC2的利用奠定了基础。