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ISSN: 2333-9721
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基于BioPerl实现精确下载毛果杨蛋白质序列
Realize Accurately the Download of Populus trichocarpa Protein Sequences Based on BioPerl

DOI: 10.12677/HJCB.2016.62004, PP. 27-32

Keywords: 毛果杨,蛋白质,蛋白质序列,BioPerl
Populus Trichocarpa
, Protein, Protein Sequences, Bioperl

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Abstract:

本文以毛果杨(Populus trichocarpa)和蛋白质名称为关键词,基于BioPerl设计了下载毛果杨家族蛋白质序列的程序。此程序为构建毛果杨蛋白质二次数据库奠定了基础,也为以毛果杨蛋白质为研究对象的研究人员提供了一个方便快捷精确获取毛果杨蛋白质序列的手段。
Based on Populus trichocarpa (Populus trichocarpa) and Protein as keywords, a program was designed to download the protein sequences of Populus trichocarpa family based on the BioPerl. This program laid a solid foundation for building secondary database of Populus trichocarpa protein, and it also provided a quick and accurate method for accurately acquiring the protein sequences of Populus trichocarpa for researchers who studied the protein of Populus trichocarpa.

References

[1]  罗静初. 分子生物信息数据库[A]. The 2nd Cross-Straits Symposium on Biology-Inspired Theoretical Problems— Pro-ceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop. 北京: 中国高等科学技术中心, 2000: 41.
[2]  吴大强, 蔡诚, 魏国, 等. 毛果杨全基因组NBS类型抗病基因分析[J]. 林业科学, 2009, 45(2): 152-157.
[3]  Barker, W.C., Garavelli, J.S., Huang, H., et al. (2000) The Protein Information Resource (PIR). Nucleic Acids Research, 28, 41-44.
[4]  万跃华, 何立民. 网上生物信息学数据库资源[J]. 情报学报, 2002, 21(4): 497-512.
[5]  Stoesser, G., Baker, W., van den Broek, A., et al. (2003) The EMBL Nucleotide Sequence Database: Major New Developments. Nucleic Acids Research, 31, 17-22.
http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkg021
[6]  喻娟娟, 戴绍军. 植物蛋白质组学研究若干重要进展[J]. 植物学报, 2009, 44(4): 410-425.
[7]  李淑娟, 张超, 等. 毛果杨HDAC基因家族序列及其表达分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2015, 43(3): 63-76.
[8]  安飞飞, 李庚虎, 陈霆, 等. 植物耐寒生理及蛋白质组学研究进展[J]. 中国农学通报, 2015, 3(14): 96-101.
[9]  李磊, 罗杰, 李红, 罗志斌. 毛果杨全基因组铵转运蛋白家族成员及其序列分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2011(2): 133-142.
[10]  向福, 余龙江, 栗茂腾, 等. 用bioperl实现种子植物18S rRNA基因序列的大规模获取[J]. 华中农业大学学报, 2005, 24(4): 330-333.
[11]  向福, 陈悟, 余龙江. 基于Bioperl的基因序列获取的程序设计与实现[J]. 生物技术, 2004, 14(6): 64-66.
[12]  张晓婧, 曹兴芹, 潘伟民. 基于BioPerl实现从NCBI中精确下载LEA基因序列[J]. 计算生物学, 2014, 4(2): 13-19.
[13]  周猛, 童春发, 施季森. 充分利用Bioperl加速生物信息学的研究[J]. 生物信息学, 2008, 6(1): 43-45.
[14]  BioPerl. Installation. http://bioperl.org/INSTALL.html

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