肝组织选择性转录因子调控网络的构建初探

目的：构建肝脏组织选择性转录因子的调控网络。方法：按照基因功能的差异对组织选择性affymetrix探针集（共3919条探针）进行聚类，挑选肝组织选择性转录因子(liver-selectivetranscriptionfactor，lstf)基因进行研究。收集各基因上游的500个核苷酸启动子序列，再预测这些基因对应的转录因(transcriptionfactors,tfs)以及转录因子结合位点(transcriptionfactorbindingsites,tfbs)，并构建lstf的转录调控网络(transcriptionalregulatorynetwork)。结果：获得4个lstf基因，利用两款软件预测得到4个相同tfs，每个lstf基因上存在多个tfs的结合位点，根据3款蛋白质相互作用软件和相关文献作出的转录因子调控网络（包含lstf、预测的tfs和与其密切相关的其它几个基因），显示各个基因受到复杂的调控，其中肝组织选择性转录因子id2和prox1处于网络的显著位置。结论：结合文献分析，id2和prox1参与调节肝细胞生长分化等过程，在lstf的转录网络中可能发挥重要的调控功能。