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ISSN: 2333-9721
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橡胶树死皮病胶乳c-乳清差异表达蛋白质的筛选与鉴定

Keywords: 巴西橡胶树,死皮病,双向凝胶电泳,蛋白质组,质谱

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Abstract:

橡胶树死皮病(tappingpaneldryness,tpd)在世界各橡胶种植园普遍发生,给橡胶种植业带来严重的危害。为了更好地了解和阐明死皮病发生、发展的分子机制,本研究应用双向凝胶电泳技术(2-de)比较橡胶树死皮株与健康株胶乳c-乳清蛋白质组表达的差异。采用固相ph梯度双向凝胶电泳分离橡胶树死皮株与健康株c-乳清的总蛋白质,凝胶经考染显色后,用pdquest7.40图像分析软件进行比较分析,识别差异表达的蛋白质。这些点经过胶内酶切后进行基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(maldi-tof-ms)分析获取肽质指纹图谱(pmf),mascot软件搜索swiss-prot和ncbinr数据库鉴定蛋白质。结果:①橡胶树死皮株与健康株c-乳清凝胶的平均蛋白质点数分别为1075±35和1134±27,其平均匹配的点数分别为982±38和1008±22,组内图像匹配率达91.89﹪和88.72﹪。②橡胶树死皮株与健康株c-乳清组间的平均匹配蛋白点数为970±25。利用maldi-tof-ms质谱技术对40个差异明显的蛋白点进行分析鉴定,通过查询数据库鉴定了27个蛋白质。本研究建立了分辨率高且重复性较好的橡胶树死皮株与健康株胶乳c-乳清的双向凝胶电泳图谱,并应用质谱技术鉴定了其中表达差异的蛋白质点,这些差异表达的蛋白质可能参与了死皮发生和发展的过程。

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