家鸭细胞色素c氧化酶ⅲ（coⅲ）基因的克隆及序列分析

线粒体是存在于绝大多数真核细胞内的一种基本的、重要的细胞器，是细胞进行氧化磷酸化的场所。不同脊椎动物同源基因序列的比较显示,细胞色素b(cytb)、细胞色素c氧化酶ⅰ（coⅰ）、细胞色素c氧化酶ⅱ（coⅱ）、细胞色素c氧化酶ⅲ（coⅲ）基因最保守,同源性最高,atpase6、atpase8基因、nd基因变异比较大。本试验以家鸭（家鸭起源于绿头鸭：anasplatyrhynchos）肝脏的线粒体dna为模板，按照genbank已经公布的潜鸭族（af090337）的全序列及其绿头鸭的mtdna部分序列（l22476、l16770、l22477）设计合成特异引物进行pcr扩增，克隆并测定了线粒体细胞色素c氧化酶ⅲ亚基（coⅲ）的全序列784bp以及atpase6基因的3'端和trna-gly基因的5'端序列共934bp。用dnastar分析软件对家鸭与genbank中7种禽类的coⅲ序列进行比较分析，显示家鸭与这些动物的coⅲ基因具有较高的同源性，与同科潜鸭属中的aythyaamericana的相似性最高为90.6%，与同目不同科的加拿大雁、小天鹅、白额雁的相似性分别为89%、88.6%、88.6%。根据家鸭与其他7种禽类的coⅲ基因序列相似性所建立的进化树，与传统的分类地位基本吻合。