大肠埃希氏杆菌uti89分泌蛋白组的预测分析

目的：从大肠埃希氏杆菌uti89基因组中筛选出全部潜在的分泌蛋白并进行初步研究。方法：使用signalp3.0、tatp1.0、secretomep2.0等蛋白分析软件对5211个orf进行预测；对筛选出的信号肽及分泌蛋白的基本特征进行统计学分析；使用blast2sequences进行同源性分析。结果：共筛选出432个sec途径分泌蛋白，19个tat途径分泌蛋白，386个非经典分泌蛋白；信号肽、分泌蛋白平均长度分别为25.5aa、282.8aa；信号肽中出现频率最高的3种氨基酸依次为l、a、s；仅有两个信号肽的氨基酸序列完全相同，相应的分泌蛋白高度同源。结论：大肠埃希氏杆菌uti89基因组中有837个orf可能编码分泌蛋白；分泌蛋白集中在500aa以下；组成信号肽的氨基酸相对保守，多数为疏水氨基酸；信号肽变异性较大，含相同信号肽的蛋白可能由同源基因编码。