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ISSN: 2333-9721
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牦牛mt-ⅰ/-ⅱcdna分子克隆及其蛋白质结构分析

Keywords: 牦牛,金属硫蛋白,cdna,分子克隆,结构预测

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Abstract:

利用基因特异引物ymtsp1和ymtsp2,通过rt-pcr从牦牛肝脏组织rna中克隆出了牦牛mt-ⅰ(genbankaccessionno:ay513744)和mt-ⅱ(genbankaccessionno:ay513745)基因编码区全长。将牦牛mt-ⅰ和mt-ⅱcdna序列在cbi上进行同源性搜索发现,牦牛mt-ⅰ/-ⅱ编码区序列在不同哺乳动物中相当保守。牦牛mt-ⅰ和mt-ⅱ编码的mt-ⅰ和mt-ⅱ蛋白分别由61个氨基酸组成,其具有保守的短肽结构如:c-x-c,c-c-x-c-c,c-x-x-c等,其决定mt蛋白分子的整个三维结构,在分子进化上十分保守。同时对牦牛mt的疏水性和跨膜区分析表明,牦牛mt蛋白可能不存在跨膜区,也不存在信号肽,是1种非分泌蛋白。并通过同源比较模建,预测和构建了牦牛mt-ⅰ和mt-ⅱ蛋白的分子空间结构,表明牦牛mt-ⅰ和mt-ⅱ由α-和β-两个结构域组成,在α-结构域含有5个cys短肽结构,β-结构域有4个cys短肽结构,且2个结构域由保守的三肽序列kks相连。

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