新疆盐生植物车前pmnhx1基因的克隆及生物信息学分析

盐分对植物的伤害主要是na+引起的，而na+/h+逆向运输蛋白催化na+/h+逆向跨膜运输，从而使质膜上na+运出细胞和液泡膜中的na+区隔化。这是植物尤其是盐生植物抵御盐胁迫的主要方式之一。根据不同植物编码液泡膜逆向运输蛋白基因的保守序列，设计简并引物，采用rt-pcr和race技术，首次从新疆盐生植物车前（plantagomaritima）中克隆到na+/h+逆向运输蛋白基因的cdna全长2464bp，命名为pmnhx1(genbank登录号：eu233808)，该基因编码区长为1662bp，编码553个氨基酸，理论分子量为61.16kda，等电点为7.22。数据分析结果显示，该蛋白质主要定位于液泡膜上，由12个序列保守的跨膜结构域组成，其中tm3跨膜结构域上存在“lffiyllppi”-氨氯吡嗪咪结合域，并且该位点与na+有竞争作用。pmnhx1逆向运输蛋白与其他植物逆向运输蛋白的氨基酸同源性为64％~80％。通过生物信息学方法对其理化性质和功能分析进行预测，这为进一步研究转耐盐基因pmnhx1及其功能鉴定奠定了基础。