|
中国生物工程杂志 2009
条斑紫菜sams基因克隆与生物信息学分析Keywords: 条斑紫菜,s-腺苷甲硫氨酸合成酶,克隆,生物信息学 Abstract: 干旱、高盐和低温是限制植物生长和农作物产量的主要逆境因子。s-腺苷甲硫氨酸合成酶(s-adenosylmethioninesynthetase,sams)与植物抗逆境密切相关,而且超表达sams的转基因植物具有更高的抗干旱、高盐和低温能力。进行条斑紫菜(porphyrayezoensis)s-腺苷甲硫氨酸合成酶基因(pysams)cdna的克隆及序列特征分析。首先利用电子克隆技术得到基因相关的contig,预测全长并设计引物,最后利用rt-pcr技术成功克隆了pysams的cdna序列(genbankaccession:fj404748)。该cdna序列含有长1155nt的完整orf,编码蛋白(pysams)分子量41.8kda,长384aa。pysams与盘基网柄菌(dictyosteliumdiscoideum)、莱茵衣藻(chlamydomonasreinhardtii)、拟南芥(arabidopsisthaliana)和水稻(oryzasativa)等多种生物的sams具有较高的序列一致性,含有与sams酶活性密切相关的氨基酸残基和保守序列,与人(homosapiens)和大肠杆菌(escherichiacoli)的sams具有高度相似的三维结构。所以pysams与其它生物的sams一样,在条斑紫菜的抗逆过程中发挥重要作用。研究pysams有助于阐明条斑紫菜耐受非生物胁迫的作用机理,有助于获得高抗逆转基因植物。
|