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ISSN: 2333-9721
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一种提高外显子预测的改进周期3消噪策略

Keywords: ,ppa算法,基因编码序列(外显子),功率谱,周期3性

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Abstract:

?为提高外显子的预测精度,文章中用到了一种改进的算法-ppa算法(post-processingalgorithms)。ppa算法通过比较滤波前后dna信号n/3处的频谱分量的方法来去除噪声。将ppa算法分别应用到处理离散傅立叶变换(dft),成对的频谱分析(psc)和改进的gabor小波变换(mgwt)的周期3系数来实现周期3的去噪。算法的性能在hmr195、burset/guigo570、asp67三个数据库中进行了评估,并把受体工作特征(roc)、特异性、灵敏度曲线三个方面作为评测标准。通过实验分析,验证了ppa算法能够有效地提高外显子的预测精度,同时基于小波变换的策略确保了模型的独立性。

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