一种gpcr跨膜螺旋形变的建模方法

跨膜螺旋是gpcr的最主要特征，单个螺旋的预测精度直接影响gpcr整体三维结构的预测oupcr螺旋形变预测是一个挑战性的难题。该形变用发生形变的残基位置和该位置前后两端螺旋的夹角表示。基于目前已知的所有〔}pcr的跨膜螺旋结构，根据螺旋序列相似度进行聚类，然后在每类中对形变角度用连续型vonmiscs概率分布来建模。对建模后gpc;r跨膜螺旋的形变角度进行了回归和预测测试。基于本文方法的模型，只需进行ij次采样，就会有一次的采样结果近似符合天然螺旋的形变角度，这在很大程度上能够帮助跨膜螺旋空间结构的预测。