ppi网络聚类的评价方法的研究与应用

蛋白质相互作用网络(protein-proteininteraction,ppi)聚类结果的评价方法的研究是检测ppi网络功能模块聚类结果正确与否的关键。介绍并分析了4种有代表性的ppi网络聚类的评价方法,即p-value、匹配统计量、基于准确率和查全率的综合评价以及基于层结构的hf-measure,在此基础上考虑了主错误划分类与该预测类的相似性,提出了新的罚分函数和新的sf-measure评价方法。仿真结果表明了各评价方法的特点及sf-measure评价方法的有效性及合理性。