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癌变·畸变·突变 2009
建立在芯片与生物信息学预测基础上的mirna靶基因鉴定研究进展Abstract: ?microrna(mirna)是一类长度约22个核苷酸(nt)的非编码单链小rna分子。近年来,大量的研究证明,mirna参与了许多重要的生物学过程,其异常表达在肿瘤的发生发展中扮演着癌基因或抑癌基因的角色。关于与肿瘤相关mirna的实验研究方案通常包括4个步骤:①通过基因芯片技术对癌组织与配对的正常组织中差异表达的mirna进行筛查,确定候选mirna;②通过生物信息学软件对所获差异表达的mirna进行靶基因预测,为后续鉴定差异表达mirna的靶基因提供线索;③通过risc免疫共沉淀、稳定同位素标记蛋白质谱或mirna_mrna复合物分析等实验方法对mirna的靶基因进行实验室鉴定;④分析差异表达的mirna及其靶基因与病理、肿瘤复发转移情况以及生存期等临床指标之间的相关关系,确定mirna的肿瘤生物学意义。在本文中,结合我们实验室最近利用基因芯片技术研究食管癌中差异表达mirna及其靶基因的实验结果,综述了目前mirna及其靶基因鉴定方面的最新研究进展。
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