拟南芥iqm2cdna的克隆与生物信息学分析

？拟南芥iqm2由at3g13600编码,是iqm家族的第二个成员,但在各种分子生物学相关的文献和数据库中都找不到其cdna序列.本研究采用race和rt-pcr技术,克隆得到拟南芥iqm2基因的全长cdna序列.该cdna长2245bp,其开放阅读框长1818bp,编码1个由605个氨基酸残基组成的多肽链.生物信息学分析表明,iqm2蛋白含有一个iq基序,属于钙不依赖性钙调素结合蛋白;其n端与豌豆重金属诱导蛋白6(hmip6)有较高的同源性,而iq基序则分布在hmip6结构域内部;其c端与栝楼天花粉蛋白(trichosanthin)n端具有较高的同源性.