dna条形码(its2)在葫芦科鉴定中应用价值的评估

？探讨在纳入分析数据时,数据信息的选择对its2序列作为dna条形码在葫芦科植物中鉴定能力的影响。首先,建立由葫芦科植物its2序列组成的3个资料组,其中dataset1为实验样本,dataset2由实验样本及genbank数据库样本组合,dataset3为从dataset2中去除部分序列后所得。通过比较3个资料组的种间、种内的变异、barcodinggap及鉴定成功率,评估纳入分析的数据选择差异对its2鉴定能力的影响。结果显示its2序列在3个资料组属水平上的鉴定成功率均达到100%;种水平上,用blast1法鉴定成功率分别为100%、67.8%、90.6%,nearestdistance法鉴定成功率分别为100%、52.5%、66.5%。可见纳入分析的数据选择有差异时,会导致鉴定成功率的较大变化。3个资料组中,its2分析仅有dataset2的barcodinggap不够显著。因此对于dna条形码分析中的数据纳入标准,值得进一步研究。