青杄中sppa1的cdna序列克隆及其生物信息学分析

？以青杄(piceawilsonii)均一化cdna文库为模板,通过race方法克隆得到青杄ppa1基因cdna全长,对该cdna序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、二级结构、三级结构及是否跨膜进行了分析预测;进行了多序列比对并构建了系统树,同时对ppa1在青杄各组织中的表达量进行了检测。结果表明:青杄ppa1基因共由216个氨基酸组成,分子量为24.55kd,理论pi为5.83,属可溶性蛋白;二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲和β-折叠构成;ppa1在青杄花粉中表达量最高。研究为进一步研究青杄ppa1的功能奠定了基础。