蛇苔细胞色素c(cytc)的序列分析及功能预测

？通过核酸序列比对,在蛇苔cdna文库中获得细胞色素c(cytc)基因序列,并对其编码的蛋白质产物从同源性、氨基酸组成、理化性质、亚细胞位点、结构和功能等进行生物信息学分析和预测。结果表明,该cdna序列具有完整的开放阅读框(orf,104～442bp),推测编码蛋白为112个氨基酸,与向日葵、荞麦、玉米等cytc存在着较高的保守性(相似性分别为84%、85%和84%),同属于细胞色素c超家族;蛇苔cytc蛋白的分子量为11998.7da,不含信号肽,成熟的cytc起始于ala2,其活性位点为cys23、cys26、his27和met89;对蛋白质的翻译后修饰预测表明ala2存在乙酰化修饰,lys81和lys95分别进行三甲基赖氨酸修饰。这些特点与其他植物cytc保持一致,表明该基因为蛇苔cytc基因,在进化上相对保守。