丹参btf3基因的克隆及生物信息学分析

？采用pcr及rt-pcr技术分别从丹参基因组dna和cdna水平克隆了通用转录因子3(basictranscriptionfactor3,btf3)基因,运用生物信息学方法对该基因编码氨基酸序列的组成成分、疏水性/亲水性、翻译后修饰、蛋白质高级结构等进行预测,利用实时荧光定量pcr检测丹参不同器官以及脱落酸和干旱诱导下btf3的表达情况。结果表明:丹参btf3基因全长为1510bp,包含5个外显子和4个内含子;cdna全长794bp,编码蛋白整体表现为亲水性,二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲组成,具有nac结构域,与其他植物的btf3在序列组成、结构及活性位点上有高度的相似性。丹参btf3基因在根、茎、叶中均有不同程度的表达,表达丰度为:根>茎>叶;aba诱导该基因表达量24h内没有显著的变化;干旱胁迫下该基因的表达受到抑制。