番茄p56和部分来源多糖裂解酶家族ⅰ的其它蛋白的系统演化分析

？果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶(pectatelyase)和果胶酸酯裂解酶(pectinlyase)二种形式,是一类多糖裂解酶,由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生,分布在5个多糖裂解酶家族,果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等工业中有广泛的应用。利用ncbiblastx服务器,搜索与番茄p56蛋白氨基酸序列相似且都属于多糖裂解酶家族ⅰ的果胶裂解酶蛋白序列共28条,用dnaman软件分析其保守区,用clustalx8.0软件进行序列比对和bi-oedit软件进行文件转换,进一步用puap4.0软件构建系统进化树。构建的mp树(phylogenetictrees)和nj树(neighbor-joining)显示:来自植物的果胶酸裂解酶、真菌的果胶酸酯裂解酶、细菌的果胶酸裂解酶分别可聚为一个独立的类群;相对于细菌果胶酸裂解酶和真菌果胶酸酯裂解酶而言,构巢曲霉(aspergillusnidulans)的果胶酸裂解酶a和植物的果胶酸裂解酶之间有较近的亲缘关系;细菌pseudomonassyringae的果胶酸酯裂解酶和真菌的果胶酸酯裂解酶之间的亲缘关系较近。