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ISSN: 2333-9721
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灯盏花chi的克隆及其生物信息学分析

Keywords: 灯盏花,查尔酮异构酶(chi),rt-pcr(polymerasechainreaction),race(rapidamplificationofcdnaends),序列分析

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Abstract:

?查尔酮异构酶(chi)是调控黄酮生物合成的关键酶,分离和克隆这一酶的功能基因,对利用转基因技术进行灯盏花黄酮生物合成的调控具有重要意义。本研究采用rt-pcr和race技术,获得了chicdna全序列,genbank登录号为gu208823.1,序列全长996bp,开放阅读框为594bp,编码197个氨基酸,3-race有一个多聚腺苷酸加尾信号。应用软件预测该基因编码蛋白分子量约为21.6kd,理论等电点为4.78。该基因编码的蛋白无跨膜结构域,其二级结构的主要构件为α-螺旋和随机卷曲。对其三级结构进行了建模,表明其结构与苜蓿chi的三级结构相似。同时根据灯盏花chin端序列变化的特征,提出了灯盏乙素的合成可能与chi在细胞亚结构的定位及其与合成代谢相关酶形成复合酶的特异性有关。研究为利用基因工程定向改变灯盏花黄酮代谢产物奠定了基础。

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