鸡贫血病毒（cav）vp1基因的克隆及与其他cavvp1基因的比较

摘要把一个新鸡贫血病毒（cav）的vp1基因通过pcr扩增，然后克隆到质粒载体puc18上.vp1基因包含1347个碱基对，并且推定的vp1蛋白氨基酸序列含有449个氨基酸.通过dnablast软件把该基因的序列数据与在genbank中发表的其他vp1基因比较显示，克隆的vp1基因与已发表的其他vp1基因之间存在许多核甘酸差异.核甘酸的变异导致其编码蛋白质的某些氨基酸发生改变.氨基酸的改变主要集中在vp1蛋白的29、75、125、141、144、251、254、447位.在这些变异中，许多氨基酸的电荷和/或疏水性发生了改变，例如：gly→glu、val→glu、ala→thr、leu→gln、cys→trp、leu→arg、arg→ala、gly→ser、ser→ala、glu→gly、gly→thr等.通过clustalx软件比较了6个不同的vp1基因.该vp1基因已被genbank登录（登录编号：af448446）.vp1蛋白是cav的唯一衣壳蛋白，因此vp1的氨基酸变异可能影响该蛋白质的抗原特征.对该vp1基因进一步进行免疫学研究具有重要意义，并且有可能应用该基因构建cav基因工程疫苗.图1表3参20