马铃薯x病毒山西分离物外壳蛋白基因的克隆和核苷酸序列分析*

对genbank公布的马铃薯x病毒的基因组核苷酸序列和外壳蛋白基因的核苷酸序列进行了同源性比对分析.结果表明，马铃薯x病毒外壳蛋白基因核苷酸序列的同源性要高于基因组全序列的同源性，并且外壳蛋白基因3’端核苷酸序列的同源性又高于5’端.设计一对特异性引物，以马铃薯感病植株的总rna为模板，经rt-pcr扩增得到了马铃薯x病毒外壳蛋白基因.该基因含714个核苷酸，编码238个氨基酸.核苷酸序列比对结果表明，该基因与genbank公布的马铃薯x病毒其他分离物的外壳蛋白基因的同源性为80.2%~97.5%，且3’端的同源性要高于5’端.上述结果预示，rna干扰抗病毒基因工程中，利用马铃薯x病毒外壳蛋白基因的3’端比用5’端是更好的策略.图3表4参17