甲型流感病毒h5n1的sirna设计

摘要选用了甲型流感病毒10个毒株(全序列)和一个2004年越南毒株(部分序列),采用自己编写的计算机程序srnafinder,对每个毒株的6个rna片段的6个编码序列进行了sirna设计.结合系统发育重建方法,利用srnafinder的共有序列分析功能,对得到的6101个sirna分子进行了计算机筛选.结果表明,设计的sirna的分子,针对np和pb1应该是最有效的,而针对ha和na的sirna分子设计,需要疾病流行期毒株的最新测序数据;从ns1的数据不能获得很保守的、可作为预防或治疗药物的sirna分子.图1表4参16