苏云金芽孢杆菌新基因cry1ab17的克隆和生物信息学

摘要利用高效克隆pcr产物的专用载体pmd18？t，直接从苏云金芽孢杆菌wb9的pcr产物中克隆了cry1ab17新基因.测序结果表明，该基因(genbank登录号为ay646166)由3471个碱基组成，其编码的蛋白质含有1156个氨基酸残基，其中亲水性氨基酸占30.8%，疏水性氨基酸占45.2%，酸性氨基酸占12.9%，碱性氨基酸占11.1%.氨基酸序列的同源性分析结果表明，cry1ab17蛋白与已报道的cry1ab蛋白同源性为95.4%～99.7%，该蛋白的4个氨基酸残基――pro170、gly449、gly796和gly863与其它已报道cry1ab蛋白相应位置的氨基酸残基均不同.在核苷酸序列和氨基酸序列多重比较的基础上，应用paup4.0构建了cry1a蛋白家族的系统发育树.signalp分析结果显示，cry1ab17蛋白中不含信号肽序列.此外，对cry1ab17蛋白的二级结构和3个结构域也进行了预测和分析.图4表2参15