基因芯片技术筛选和鉴定cd133+cd200+大肠癌干细胞相关基因

目的筛选cd133+cd200+大肠癌细胞并鉴定其相关基因的表达。方法流式细胞术分选cd133+cd200+和cd133-cd200-大肠癌细胞，应用affymetrix人类全基因组表达谱芯片检测这两群细胞的基因表达谱，初步筛选cd133+cd200+与cd133-cd200-大肠癌细胞之间的差异表达基因，进而寻找与大肠癌干细胞特异性相关的主效基因，最后利用qrt-pcr实验对部分差异表达基因进行验证，以确定芯片检测结果的可靠性。结果芯片结果显示差异在3倍以上的基因共655个，cd200+细胞表达上调的基因290个，表达下调的基因共365个，通过生物信息学分析和genemania共表达构建，筛选出3条（mdm2；prkacg；cacna1g）有特异相关的差异基因进行qrt-pcr验证，结果与芯片结果完全相符。结论基因芯片技术通过筛选和鉴定cd133+cd200+大肠癌干细胞相关基因，建立了特异性大肠癌干细胞基因表达谱，为大肠癌基因靶向治疗及进一步研究提供依据。