sars冠状病毒s2基因变异性分析

目的测定sars冠状病毒gd322株s2基因序列并对sars-covs2基因进行系统进化树分析。方法用rt-pcr法从sars-covgd322株基因组中扩增s2基因片段并克隆至pgem-t载体,转化大肠杆菌dh5α株后测序。利用lasergene、clustalx、dnaman和treeview等软件,将基因序列翻译成氨基酸序列后,与早、中、晚期各地暴发的sars-covs2蛋白序列进行比对,构建系统进化树,并在internet网数据库中对s2蛋白氨基酸序列进行t细胞抗原表位预测。结果随着sars-cov的传播流行,s2基因趋于稳定,晚期的sars-covs2基因的同源性达到99．9％。t细胞抗原表位预测发现,sars-covs2蛋白第57位氨基酸突变对t细胞抗原表位有影响。结论sars流行过程中sars-covs2基因较为稳定,s2蛋白57位氨基酸的突变可影响病毒t细胞抗原表位。